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日志

小胖说统计之二一一:肿瘤临床试验中的统计学问题(二十七)

热度 1已有 1090 次阅读2009-12-30 10:47 |

生存分析(十三)

 

上边小胖简单介绍了KaplanMeier法,下图是上边那个实例最后形成的两组AB组病人的K-M曲线如下:

 

 

那么A组和B组生存时间到底有没有差别呢?这时我们最常用的统计方法便是Log-rank检验。

我们首先来看一下Log-rank检验的检验假设:

 

H0SA(t)=SB(t)

H1:  SA(t)≠SB(t)

 

即检验A组和B组的生存分布是否相同,即检验上边图中的两个生存曲线的分布是否相同。

 

Log-rank检验通常也被人称为Mantel-Haenszel 检验,其实Log-rank检验其实就是Mantel-Haenszel 的应用,下边我们结合上边这个例子,来对Log-rank检验的具体方法作一简单介绍。

 

原始数据:

 

A组: 10 212+,13186+,1924+,9+,8

B组: 2+,13711+,611124+,6

 

 

1)两组合并进按时间进行排序,得出时间点:

 

12 4 6 78910111213181924

 

 

2)根据时间点形成下列表格

 

时间

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

期初总数

死亡

Censoring

生存

 

期初总数

死亡

Censoring

生存

1

10

0

0

10

 

10

1

0

9

2

10

1

0

9

 

9

1

1

7

4

9

0

0

9

 

7

0

1

6

6

9

0

1

8

 

6

2

0

4

7

8

0

0

8

 

4

1

0

3

8

8

1

0

7

 

3

0

0

3

9

7

0

1

6

 

3

0

0

3

10

6

1

0

5

 

3

0

0

3

11

5

0

0

5

 

3

1

1

1

12

5

0

1

4

 

1

0

0

1

13

4

1

0

3

 

1

1

0

0

18

3

1

0

2

 

0

0

0

0

19

2

1

0

1

 

0

0

0

0

24

1

0

1

0

 

0

0

0

0

 

 

3)列出每个时间的2X2四格表

 

1个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

0

10

10

B

1

9

10

合计

1

19

20

 

 

 

2个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

1

9

10

B

1

8

9

合计

2

17

19

 

 

 

4个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

0

9

9

B

0

7

7

合计

0

16

16

 

 

6个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

0

9

9

B

2

4

6

合计

2

13

15

 

 

 

7个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

0

8

8

B

1

3

4

合计

1

11

12

 

8个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

1

7

8

B

0

3

3

合计

1

10

11

 

9个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

0

7

7

B

0

3

3

合计

0

10

10

 

10个月

 

死亡

生存+censoring

合计

A

1

5

6

B

0

3

3

合计

1

8

9

 

11个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

0

5

5

B

1

2

3

合计

1

7

8

 

12个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

0

5

5

B

0

1

1

合计

0

6

6

 

 

13个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

1

3

4

B

1

0

1

合计

2

3

5

 

 

18个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

1

2

3

B

0

0

0

合计

1

2

3

 

 

19个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

1

1

2

B

0

0

0

合计

1

1

2

 

  

24个月

 

 

死亡

生存+censoring

合计

A

0

1

1

B

0

0

0

合计

0

1

1

 

 

到这一步,大家可能看出来门道了吧,log-rank检验本质就是Mantel-Haenszel检验,下一步的检验方法,就不用小胖再提示了吧,我们应该要计算格子期望数了吧。。。

 

待续。。。。

 


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