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生存分析(二十七)
说完Hazard ratio,小胖接着仔细说一下Cox PH model的PH Assumption。Cox PH model的PH Assumption要求Hazard ratio是保持不变的,不随时间的变化而变化。关于这一点,《小胖在小胖说统计之二一七》中已从Cox PH model的公式方面做出了解释,小胖就不在此赘述了。这篇博文中,我们将着重关注如何来确认到底满足不满足这个PH Assumption。
对于PH Assumption的评估一般有三种方法:Graphical, Goodness-of-fit test和Time-dependent covariates。小胖在这里主要介绍一下Goodness-of-fit test,其他两种方法,如果大家有兴趣可向小胖索取相关资料。
小胖之所以重点介绍Goodness-of-fit test,在于它有其自身的优势,它可以对每个变量进行PH Assumption进行检验,提供相应的统计量和p值,这样我们做起决定就比Graphical方法更加客观了。
至于具体的检验方法,我们给大家介绍一下Harrel and Lee在1986年提出的方法,这个方法来源于1982年Schoenfeld提出的方法,并且基于Schoenfeld定义的residuals,也就是我们现在通称的Schoenfeld residuals.
什么是Schoenfeld residuals呢?
举个例子,假设一个Cox PH model中有三个变量,治疗组、性别和基线评分,那么对于每个出现event的病人,总共有三个Schoenfeld residuals,其中每个变量对应一个Schoenfeld residual。
具体的计算方法,假设某个病人在t时间点出现了event,那么他基线评分的Schoenfeld residual就是他的基线评分值减去其他在这个时间点仍在研究中没有发生event的病人的weighted 平均评分值,而weights则是每个病人的hazard。
而检验方法的基本思想则是如果某个变量满足PH Assumption,那么这个变量的Schoenfeld residual与生存时间无关。
下一篇博文,小胖将简单介绍一下检验的具体步骤。
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