100钢镚悬赏：如何将两个两两比较放到一起比较？

发了篇鬼子的文章，说是分开比较增加1类错误，要放在一起比较。请问如何比较？比较着急，100钢镚悬赏某位有时间答疑解惑的大人。
+ x# N8 u" \  R( o
1 o  \1 J0 @/ l5 iChart 1

' x4 f# k* `! G+ ?4 y * n: u' ~( `1 F4 K8 v 8 q4 V2 G! S- J$ l7 i7 v	1 m, E% a, e" E- B% o        c—FLIP $ Z, Q% D" n4 f6 x
	negative(%)     positive(%)  P    0 P" j9 X- K  U- W
carciona tissue    9(25.7)       26(74.3)    ＜0.05                             adenoma tissue    8 (80%)       2 (20%) 7 {2 f9 k- F: B1 e8 h' Z

P value is calculated by Fisher′s Exact
: W$ e$ _* H8 n) x4 F/ d9 }$ [Chart 2
2 e. ^! D/ F: w
, b. s6 i/ o/ u* }
( `* \6 V# _" F! g; H. x

, b1 g* J" ?0 ^3 l) e, q% Q 1 s, C2 P/ K8 X( _ 7 l1 ~: `, h- _* b+ I2 Z3 S	c—FLIP
	4 ^- @2 ~2 A  h! g negative(%)     positive(%)   P
carciona tissue   9(25.7%)      26(74.3%)   ＜0.05                               I4 `4 J. N6 X9 o; m1 y: U# ^normal  tissue   9(90%)      1 (10%)   R- |! e: a; u

; ~/ t  p8 B( N9 u  T" b4 [" E
3 a; ?; U2 M( M' W% O7 ZP value is calculated by Fisher′s Exact

9 \5 w" T3 N" |& |
原意是c-FLIP在不同组织中的表达，比较在胆囊癌和正常组织 胆囊癌和胆囊腺瘤组织中的表达情况，放在一个表格中怎么处理？

我不算太专业, 但也许能给你一些启发.
2 f& L4 O! j+ {$ n4 `& p首先, 该资料可以整理成一个行*列表, 如果分开两两比较确实会加大1型错误.SPSS中数据整理见下:

tissue * cFLIP Crosstabulation
! E' ?& _; z7 I% O( a. _) {Count
( J7 L" m5 {& `! f                  cFLIP         Total
' D" U; u  K' M/ C7 T          negative    positive   
tissue  carciona tissue  9  26  35
- ?2 G% S3 n; j1 E, ~  N' G  adenoma tissue  8  2  10
: u2 i3 c+ A* \% X8 W& N  normal  tissue  9  1  10
Total    26  29  55
直接做行*列表的卡方检验得结果如下
0 t$ X( z- K% u4 b/ W  }Chi-Square Tests
) X  F0 q( |0 a8 b8 P             Value                      df   Asymp. Sig. (2-sided)
Pearson Chi-Square  18.147(a)          2            .000
Likelihood Ratio  19.669           2              .000
Linear-by-Linear Association  16.356  1  .000
N of Valid Cases  55      
9 x/ h, d7 D8 @  q# [7 t/ I% o/ ea2 cells (33.3%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 4.73.
有超过20%的格子理论频数小于5. 呵呵, 应该增大样本量.
如果增大样本量后此检验有统计学意义, 则需做样本率的两两比较, 或者多个样本率与一个对照组比较.
可以用Bonferroni法或Brundren法. 具体方法见附件, 通过调整检验水准进行, 手算也不算麻烦. 应该SAS编程可以直接处理, 可惜我不会~~

可以参见卫生统计学（第五版）114－115页。

采用2*3的卡方检验 :
1 P/ y; t0 Q" l0 RCochran-Mantel-Haenszel 统计量
5 g/ A8 ?* B5 [总体比较卡方值=16356 P<0.0001
& g8 Q) O1 r2 L) I' Z两两比较:由于比较3*(3-1)/2=3 次 调整P值为0.05/3=0.0167
) V: Z" m5 e, a1 Bcarciona tissue   与 adenoma tissue   确切概率法 P=0.0031
  carciona tissue    与normal  tissue    确切概率法 P=0.0004252
  g- v5 ~# l7 i/ R! Q差异都要统计学意义

Chi-Square Tests
先做3*2表的假设检验，见下表结果fisher确切概率Fisher&#39;s Exact Test：
Value  df  Asymp. Sig. (2-sided)  Exact Sig. (2-sided)  Exact Sig. (1-sided)  Point Probability
' Q: V& }5 L. C7 {- \& d  |2 hPearson Chi-Square  18.147(a)  2  .000  .000      
. p% h9 h9 E2 F2 |" WLikelihood Ratio  19.669  2  .000  .000      
0 A/ z" n; p: s! K6 A* C- [- R( rFisher&#39;s Exact Test  18.203      .000      
Linear-by-Linear Association  16.356(b)  1  .000  .000  .000  .000
N of Valid Cases  55            
a  2 cells (33.3%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 4.73.
b  The standardized statistic is -4.044.
1 V- p" T8 Z( [3 ] 再做两两比较，调整后的检验水准=0.05/（2*（3-1））=0.0125
, r. z  w  W( W9 ?* a! d- z$ b; Dcarciona tissue 与adenoma tissue  比较见下结果中Continuity Correction：  
Chi-Square Tests
   Value  df  Asymp. Sig. (2-sided)  Exact Sig. (2-sided)  Exact Sig. (1-sided)  Point Probability
7 G: ^! U1 l8 v/ o9 WPearson Chi-Square  9.751(b)  1  .002  .003  .003   
Continuity Correction(a)  7.578  1  .006        
7 g2 b9 u! r0 G  Z' `. eLikelihood Ratio  9.756  1  .002  .007  .003   
Fisher&#39;s Exact Test        .003  .003   
$ g, m9 `* b0 t( {: C) c5 ULinear-by-Linear Association  9.534(c)  1  .002  .003  .003  .003
" ^+ x2 w. `7 Z( p/ iN of Valid Cases  45            
a  Computed only for a 2x2 table
b  1 cells (25.0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 3.78.
c  The standardized statistic is -3.088.
carciona tissue 与normal tissue  比较见下结果中Continuity Correction：
7 G5 ?% `" E; N- ?Chi-Square Tests
   Value  df  Asymp. Sig. (2-sided)  Exact Sig. (2-sided)  Exact Sig. (1-sided)  Point Probability
; R; B6 H6 \' d6 D  C9 zPearson Chi-Square  13.393(b)  1  .000  .000  .000   
Continuity Correction(a)  10.848  1  .001        
: k4 }/ x' U4 s* ULikelihood Ratio  14.166  1  .000  .000  .000   
Fisher&#39;s Exact Test        .000  .000   
Linear-by-Linear Association  13.095(c)  1  .000  .000  .000  .000
N of Valid Cases  45            
a  Computed only for a 2x2 table
b  1 cells (25.0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 4.00.
/ S9 n3 U  q9 M/ a( ~6 n* A2 Zc  The standardized statistic is -3.619.
结果显示：可以认为c-FLIP在胆囊癌和正常组织、胆囊癌和胆囊腺瘤组织中的表达不同

先做3*2表的假设检验，见下表结果fisher确切概率Fisher&#39;s Exact Test：
Value  df  Asymp. Sig. (2-sided)  Exact Sig. (2-sided)  Exact Sig. (1-sided)  Point Probability  
) h* ]* K5 u+ R9 b2 O, ~$ J: l' s3 RPearson Chi-Square  18.147(a)  2  .000  .000     
. Q8 f7 k9 r0 U" ?4 a6 T/ KLikelihood Ratio  19.669  2  .000  .000      
$ s: C; L. V& YFisher&#39;s Exact Test  18.203      .000     
Linear-by-Linear Association  16.356
- y; b8 N4 {# R; \0 {5 W/ X  u(b)  1  .000  .000  .000  .000
% v; [3 k& J" \8 XN of Valid Cases  55            
a  2 cells (33.3%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 4.73.
b  The standardized statistic is -4.044.


2 c# }& l4 h- \' }: U4 o再做两两比较，调整后的检验水准=0.05/（2*（3-1））=0.0125

carciona tissue 与adenoma tissue  比较见下结果中Continuity Correction：
' c. m& k8 o4 {" F# G. E  B
2 _: Y1 T* u- V$ ^ Value  df  Asymp. Sig. (2-sided)  Exact Sig. (2-sided)  Exact Sig. (1-sided)  Point Probability
' g+ N+ O9 G" M$ kPearson Chi-Square  9.751(b)  1  .002  .003  .003   
* ^8 _3 {- k& m$ N: |Continuity Correction(a)  7.578  1  .006      
Likelihood Ratio  9.756  1  .002  .007  .003   
8 C# U5 t/ D* w9 Y4 ]  [1 sFisher&#39;s Exact Test        .003  .003     
Linear-by-Linear Association  9.534(c)  1  .002  .003  .003  .003
N of Valid Cases  45            
a  Computed only for a 2x2 table
b  1 cells (25.0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 3.78.
* ^; q# S# u  T9 `" U" e6 Cc  The standardized statistic is -3.088.

carciona tissue 与normal tissue  比较见下结果中Continuity Correction：
5 {4 E8 K/ _6 i6 F
Value  df  Asymp. Sig. (2-sided)  Exact Sig. (2-sided)  Exact Sig. (1-sided)  Point Probability
; D( j% `7 x* i0 [. M4 |) YPearson Chi-Square  13.393(b)  1  .000  .000  .000   
Continuity Correction(a)  10.848  1  .001        
' h8 K4 o' ]5 ^4 x; f7 HLikelihood Ratio  14.166  1  .000  .000  .000   
1 O& j4 x  y/ T8 x) IFisher&#39;s Exact Test        .000  .000   
$ t9 l5 v. M( o1 K8 i% A, JLinear-by-Linear Association  13.095(c)  1  .000  .000  .000  .000
N of Valid Cases  45           
0 m& ~: g% b3 N& Da  Computed only for a 2x2 table
# \4 J9 ~. j: _- z$ Gb  1 cells (25.0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 4.00. 
% @& k$ F& L. _4 j# W1 B. M7 v- jc  The standardized statistic is -3.619.

- D; Z# g; o* J. [! c$ e结论：
2 |  J! K; b  v结果显示可以认为c-FLIP在胆囊癌和正常组织、胆囊癌和胆囊腺瘤组织中的表达不同

多谢各位了

这个问题， 也要考虑到你的实验设计吧。 用3*2 chisq test的前提是你的carcinoma, adenoma, and normal tissue 都是独立的实验， 就是说你的tissue都是来自不同的patients.