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[其他话题] 研究的可重复性

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alian 发表于 2022-3-4 21:47:24 | 显示全部楼层 |阅读模式

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正确理解重复性与再现性的概念

重复性(repeatability)与重现性(再现性,reproducibility),二者都是用来评价分析结果的精密度。大多数人都不作严格区分,有的文献中还常常混用。但是二者的实际意义是不一样的。重复性比重现性概念大,应用范围大。重现性内涵小,一般用在“现象”。

    一、重复性(r)

    定性定义:用相同的方法,同一试验材料,在相同的条件下获得的一系列结果之间的一致程度。相同的条件是指同一操作者,同一设备,同一实验室和短暂的时间间隔。

    定量定义:一个数值,在上述条件下得到的两次实验结果之差的绝对值以某个指定的概率低于这个数值。除非另有说明,一般指定的概率为0.95。

    重复性是用本方法在正常和正确操作情况下,由同一操作人员,在同一实验室内,使用同一仪器,并在短期内,对相同试样所作两个单次测试结果,在95%概率水平两个独立测试结果的最大差值。

    二、再现性(R)

    定性定义:用相同的方法,同一试验材料,在不同的条件下获得的单个结果之间的一致程度。不同的条件指不同操作者、不同实验室、不同或相同的时间。

    定量定义:一个数值,用相同的方法,同一试验材料,在上述的不同条件下得到的两次试验结果之间的绝对值以某个指定的概率低于这个数值。除非另外指出,一般指定的概率为0.95。

    再现性是用本方法在正常和正确操作情况下,由两名操作人员,在不同实验室内,对相同试样各作单次测试结果,在95%概率水平两个独立测试结果的最大差值。

    三个表示精密度的概念,在国外的文献中常见:

    1. 平行性(replicability):同一实验室,分析人员、分析方法均相同,对同一样品进行的多个平行样品之间的相对标准偏差;

    2. 重复性(repeatability):同一实验室,分析人员用相同的分析法在短时间内对同一样品重复测定结果之间的相对标准偏差;

    3. 再现性(reproducibility):不同实验室的不同分析人员用相同分析对同一被测对象测定结果之间的相对标准偏差。

    我个人认为我们国内常把平行性和重复性混为一谈,区别上面三个概念我个人认为平行性就是我们做一个添加样品设置的平行样之间的变异系数;重复性就是对同一被测对象我们在不同时间做出来的重复结果之间的变异系数;而再现性很好理解,就是不同实验室结果的变异系数啦。

    操作者1:29.5;28.0;28.3;29.3;28.8;29.6;28.8;28.6;27.9;28.0

    操作者2:28.6;28.1;29.7;27.4;27.5;28.4;27.0;28.4;28.2;27.7

    操作者3:26.9;28.1;28.1;28.2;29.4;29.2;27.0;26.0.26.5;27.9

    针对上面的数据如果操作者1、2、3是不同实验室的,则把三个人的10个测定值分别取平均值,再分别算出相对标准偏差,此即为“再现性”;

    如果他们三人是同一实验室的,我个人认为这三人之间的相对标准偏差就是实验室内的精密度;而其中每个人的10个数据值之间的相对标准偏差就是“平行性”或“重复性”啦。

http://www.foodmate.net/zhiliang/guanli/165753.html


随着关于重复性的讨论逐渐扭曲,美国细胞生物学学会 (American Society for Cell Biology) 的研究人员发表了一篇文章,其中抛弃了 reproducibility 一词,提出四种 replication:

Analytic replication:重新分析原来的数据来重现研究结果
“analytic replication” refers to attempts to reproduce results by reanalysing original data;

Direct replication:尝试使用与原来试验中提到的同样的条件、材料和方法重复实验
“direct replication” refers to efforts to use the same conditions, materials and methods as an original experiment;

Systematic replication:使用不同的实验条件来重现研究发现,例如使用不同的细胞系或小鼠品种进行研究
“systematic replication” describes efforts to produce the same findings using different experimental conditions (such as trying an experiment in a different cell line or mouse strain)

Conceptual replication:证明一个概念的一般有效性,这其中可能包含使用不同的生物
“conceptual replication”, which refers to attempts to demonstrate the general validity of a concept, perhaps even using different organisms.

显然,要明确地定义不可重复性没有那么简单,而且不同领域、主题甚至不同人可能都会有不同的看法。而不可重复性的核心还有缺乏透明度、没有接受培训的研究人员尝试重做复杂的实验、研究方法信息不完整等等问题。

因此,清楚明示重复或重现有困难的研究的问题,还有定义重复或重现研究背后的用意,才是解决这些议题的关键。

https://blog.sciencenet.cn/blog-769813-1224389.html
https://www.nature.com/articles/nature.2016.20076
明白人 发表于 2022-3-11 18:32:59 | 显示全部楼层
学习了 谢谢你
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